Nos dias 21 e 22 do mês de outubro, ocorreu no Instituto de Química a 23ª edição do Workshop de Bioinformática – oferecido anualmente pelo Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática da USP. Com o tema "ncRNA: Biologia e Aplicações", o evento foi organizado pelos próprios alunos, sendo o primeiro desde que o IQ passou a ser sede do Programa.
Bioinformática é uma área muito ampla, que se utiliza de várias interseccionalidades para compor sua expertise. Não à toa, a especialização oferecida pela USP trata-se de uma pós-graduação interunidades, compartilhada por 8 unidades de ensino. Possui um ciclo básico de matérias, para fornecer uma base aos alunos de diferentes áreas e diferentes especializações, e sua atual sede é o Instituto de Química.
O Workshop acontece em torno de um tema principal e o explora a partir de minicursos e palestras com especialistas, para discutir e apresentar os últimos avanços nos estudos da área. Na abertura do evento, alguns dos diretores das unidades participantes estiveram presentes – entre eles, a Profa. Dra. Patrícia Gama (ICB), o Prof. Dr. Sérgio Muniz Oliva Filho (IME) e o Prof. Dr. Pedro Vitoriano de Oliveira (IQ). Também integraram a mesa o Presidente do Programa, Prof. Dr. Eduardo Moraes Rego Reis, e o Vice-Presidente, Prof. Dr. João Carlos Setubal, ambos do IQ.
O assunto abordado neste ano, “RNAs não-codificantes”, possui avanços significativos e muito recentes. Na primeira palestra do Workshop, o convidado era Paulo de Paiva Rosa Amaral, ex-mestrando do IQUSP e professor do Insper na área de Bioengenharia. Ele falou sobre sequenciamento de RNA para caracterização funcional dos RNAs não-codificantes e explicou que só recentemente foi melhor aceito o conceito de que a maioria dos RNAs não codifica proteínas. Além disso, muitos possuem funções próprias que ainda precisam ser estudadas. “Vimos que alguns destes (ncRNAs) têm relação com a manifestação de carcinomas. [...] É difícil realizar análises preditivas de funções nos experimentos, pois muitas são humano-específicas”, conta Amaral. Ao longo de seu discurso, ele também explicou como o sequenciamento de genomas – considerado revolucionário há alguns anos – atualmente se tornou uma ferramenta relativamente acessível.
No decorrer do evento, houveram várias palestras com especialistas no tema e dois minicursos sobre programação em R e anotação de lncRNAs usando redes de co-expressão. No segundo e último dia, Helder Takashi Imoto Nakaya, docente do Departamento de Tecnologia Bioquímico-Farmacêutica da FCF/USP, ministrou uma palestra sobre os RNAs não-codificadores longos e suas caracterizações.
Nakaya conta que começou seu estudo com planos de focar na produção de proteínas, mas logo percebeu que a maior parte desses RNAs longos não tinha nada neste quesito. Então, decidiu analisar os genes que estão mais presentes em relação à vacinação – e como estes têm efeito sobre a resposta imune, efeitos adversos e outros.
Além destas atividades, ainda houve um espaço para a apresentação de pôsteres dos pós-graduandos que compõem o programa – finalizando assim mais uma edição do Workshop de Bioinformática.