Áreas de pesquisa – Pós-graduação em Bioinformática

ORIENTADOR
ÁREA DE PESQUISA
Alan Mitchell Durham
Desenvolvimento de Compiladores, Bioinformática, Implementação de Linguagens de Programação, Engenharia de Software, Computação Móvel
Aline Maria da Silva
Regulação e Função de serina/treonina proteínas, fosfatases em microorganismos, Mecanismos de patogenicidade de Xylella fastidiosa.
André Fujita
Bioinformática, Microarrays, Redes Regulatórias
Carlos Frederico Martins Menck
Estudos de Reparo de DNA e suas consequências Biológicas
Clever Ricardo Guareis de Farias
Métodos de análise e projeto de software baseados em componentes, Desenvolvimento de sistemas groupware baseado em componentes, Projeto e desenvolvimento de sistemas distribuídos, Modelagem Conceitual, Desenvolvimento Baseado em Modelos de Sistemas Sensíveis ao Contexto.
Eduardo Moraes Rego Reis
Análise integrada de dados genômicos de tumores humanos.
Fabricio Martins Lopes
Bioinformática, Reconhecimento de Padrões, Visão Computacional.
Fernando Luis Barroso da Silva
Modelagem Molecular, Bioinformática Estrutural, Interações fundamentais em Biofísica Molecular.
Glaucia Mendes Souza
Transdução de sinal da transição, crescimento/desenvolvimento, Transdução de Sinal da Cana-de-açúcar (SUCAST), Transcriptoma da Cana-de-açúcar.
Helder Takashi Imoto Nakaya
Biologia de Sistemas de RNAs Não Codificadores Longos, Imunologia de Sistemas
Helena Paula Brentani
Expressão Gênica, genomica, Microarray, Bioinformática, Câncer, Psiquiatria, diagnostico precoce de transtornos do neurodesenvolvimento
João Carlos Setubal
Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática (indicado para alunos com formação em computação ou com boa experiência em programação) e análises computacionais de dados biológicos, geralmente de genômica ou transcritômica (indicado para alunos com formação em biociências)
João Eduardo Ferreira
Banco de dados, Banco de dados para extração de conhecimento, Integração de Sistemas de Informação, Modelagem de banco de dados.
João Marcelo Pereira Alves
Filogenia (tradicional e filogenômica, Evolução de genomas, Bioinformática, Metagenômica humana, Transcriptômica de eucariontes unicelulares e bactérias por sequenciamento de segunda geração, Genômica de eucariontes unicelulares e bactérias.
Julia Maria Pavan Soler
Mapeamento Genético de Doenças Complexas, Mapeamento Genético de fatores de risco cardiovascular, Aplicação e desenvolvimento de Métodos Estatísticos na Análise de Dados Genéticos e Genômicos
Koichi Sameshima
Estudo dos mecanismos de processamento temporal de informação nos sistemas sensoriais: abordagens eletrofisiológica, psicofísica e computacional, Abordagens psicofísicas e neuropsicológicas aplicadas no estudo dos sistemas sensoriais e na avalliação de cognitiva em humanos, Neuroimagem funcional.
Luciano Antonio Digiampietri
Web 2.0 e Web Semântica, Uso de Jogos na Educação, Gerenciamento de Processos de Negócio / Workflows Científicos, Otimização em Bancos de Dados, Montagem e Anotação de Genomas, Análise de Redes Sociais e Cientometria.
Marcos Silveira Buckeridge
Estrutura e metabolismo da parede celular vegetal, Respostas de Plantas às Mudanças Climáticas Global, Ecofisiologia de Plantas Nativas, Bioquímica e Biotecnologia de Carboidratos de Plantas.
Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Biologia Molecular de Baculovirus, Cultura de Tecidos de Insetos, Sequenciamento de DNA viral em grande escala, Virologia Molecular, Estudos de expressão gênica viral por realtime PCR e RLM-RACE, clonagem de DNA, Cultivo celular para replicação viral, Detecção viral por PCR.
Pedro Alexandre Favoretto Galante
Bioinformatica, Biologia Molecular, Genética Humana e Médica, Genética Molecular e de Microorganismos.
Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio
Probabilidade e Estatística Aplicadas, Biologia Computacional, Bioinformática, Análise de Dados.
Ronaldo Fumio Hashimoto
Processamento de Imagens, Reconhecimento de Padrões, Morfologia Matemática, Bioinformática, Redes Booleanas Probabilísticas, Redes Booleanas.
Sergio Russo Matioli
Genética evolutiva, Genética quantitativa
Sergio Verjovski-Almeida
Expressão gênica diferencial em câncer, Expressão gênica em larga escala em Schistosoma mansoni – efeito de hormônios.
Taran Grant
Sistemática de anfíbios, Inferência filogenética, Herpetologia neotropical.
Tie Koide
Biologia Sistêmica de microorganismos. O Laboratório de Biologia Sistêmica de Microorganismos (LaBiSisMi) tem como *missão* contribuir para a compreensão de microorganismos, entendidos como um sistema dinâmico integrado, buscando modelos quantitativos multi-escala para entender seu comportamento, guiados pela Biologia Molecular Experimental em sinergia com a Matemática/Computação. Atualmente, trabalhamos com o estudo de uma archaea extremófila e a influência de RNAs não-codificantes na regulação gênica global.