Projetos correntes e áreas de pesquisa de João Carlos Setubal

Ph.D., Computer Science, University of Washington, 1992

Sumário

Minha área de atuação é bioinformática. Mas especificamente, trabalho com análise da informação contida em genomas (DNA), transcritos (mRNA) e proteínas, e como essas informações podem ser usadas para uma melhor compreensão dos organismos e de suas histórias evolutivas.

Estas pesquisas podem contribuir para áreas de interesse da sociedade tais como medicina, agricultura, energia, e meio ambiente.

No meu grupo desenvolvemos e utilizamos ferramentas computacionais para tarefas diversas relacionadas ao objetivo acima. Na maioria dos casos tais ferramentas precisam lidar com grande volume de dados (por exemplo, milhões de sequências de DNA).

Projetos correntes:

• Estudo de microbiomas em variados ambientes
  • Desenvolvimento de ferramentas computacionais para análise de microbiomas
  • Reconstrução de genomas a partir de dados metagenômicos e sua análise
• Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3). Projeto financiado pela FAPESP.
• Projeto BigD: O conjunto de ferramentas computacionais bigDiscovery (bigD) em bioinformática e genômica. Projeto financiado pelo CNPq.
• Metagenômica de microbiotas do Zoológico de São Paulo
• Estudo da expressão gênica na angiogênese

Se você se interessou por algum dos temas acima, não deixe de consultar minha página de publicações. É uma ótima forma de conhecer o resultado das pesquisas nesses temas.